Der See von Lesina liegt im gleichnamigen Naturschutzgebiet, ein 1981 zum Aufstocken von Tieren eingerichtetes Gebiet zum Schutz der in dieser Gegend nistenden Vogelarten. Hier befindet sich auch das Besucherzentrum „Lago di Lesina“ des Gargano-Nationalparks mit dem ethnographischen Museum „La Casa del Pescatore“, dem Botanischen Garten und dem Naturkundemuseum, das über ein in Europa einzigartiges Brackwasser-Aquarium verfügt.
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